Wykonuje się ją przed rozpoczęciem pracy, po zakończeniu, a także po każdej sytuacji, która mogła wprowadzić zanieczyszczenia (np. rozlanie, dotknięcie niejałowym przedmiotem, przerwanie pracy). Celem jest utrzymanie możliwie niskiej liczby drobnoustrojów na stanowisku i ograniczenie ryzyka skażenia.