Najpierw ustal, co chcesz uwidocznić: ścianę komórkową, kapsułę, kwasooporność, jądro komórkowe itp. Potem dobierz metodę ukierunkowaną na dany składnik. Dla grzybów i polisacharydów ściany komórkowej typowym wyborem jest PAS, bo jest chemicznie "nastawiony" na cukry w strukturach.