To etap, w którym ustala się przyczynę różnicy inwentaryzacyjnej, wartość niedoboru oraz sposób jej ujęcia w ewidencji. W praktyce obejmuje dokumentację (protokoły, wyjaśnienia), kwalifikację (zawinione/niezawinione) oraz wskazanie, czy tworzy się roszczenie, należność, czy księguje stratę jednostki.